第四章：微生物代谢

1. 重要基本概念

2. 异养微生物的生物氧化和分解代谢

3. 能量转换

4. 合成代谢(anabolism)：微生物特有的耗能代谢CO2固定、生物固氮、肽聚糖的合成及其它

5. 微生物代谢调节

6. 微生物次级代谢和初级代谢

重点：异养微生物利用转化葡萄糖到丙酮酸的5条主要途径及其特征性酶或关键酶。掌握发酵、有氧呼吸与无氧呼吸概念中的主要关键点及产能比较。不同类型的酒精发酵和乳酸发酵、各种有机酸发酵、氨基酸发酵。硝酸盐呼吸及其意义。各类微生物的产能类型、途径或方式的不同，特别是其他生命所不具备的产能方式以及微生物所特有的耗能合成代谢。微生物独特的代谢调节方式和类型。底物水平、氧化磷酸化和光合磷酸化产能方式的不同。蓝细菌、不产氧光合细菌及嗜盐光合生物利用光能途径的特点及不同。同化或固定CO2的6条途径。

第五章：微生物的生长繁殖及其控制

1. 细菌的个体生长

2. 细菌的群体生长

3. 真菌的生长繁殖

4. 微生物生长的测定

5. 影响微生物生长的(环境)因素

6. 有害微生物的控制

重点：微生物群体生长规律以及如何应用这些规律指导微生物生物技术产品的生产。微生物生长的测定的方法技术、原理、优缺点和适应性。通过了解掌握影响微生物生长的主要因素来调控微生物的生长，以及如何有效的控制 有害微生物的生长。掌握微生物无菌技术和菌种保藏技术。了解常用消毒剂、杀菌剂的作用范围及机制。

第六章：病毒

1. 病毒的特点和定义

2. 病毒的宿主范围

3. 病毒的分类与命名

4. 病毒学研究的基本方法

5. 毒粒的性质

6. 病毒的复制

7. 病毒的非增殖性感染

8. 病毒与宿主的相互作用

9. 亚病毒因子

10. 病毒举例

重点：病毒的定义和特点：病毒的定量测定蚀斑测定 群体特征(包涵体和蚀斑)病毒的复制。依照2012年发表的ICTV的病毒分类与命名第9次报告，对病毒的分类进行了修改，对朊病毒内容进行了少许补充，将类病毒调整到亚病毒侵染因子部分，并对禽流感病毒和SARS冠状病毒分别补充了最近发现的禽流感病毒H7N9 和中东呼吸综合症冠状病毒。

第七章：微生物遗传

1. 遗传的物质基础

2. 微生物的基因组结构

3. 染色体外的遗传物质：质粒和转座因子

4. 基因突变及修复

5. 细菌基因转移和重组

6. 微生物育种

7. 微生物基因表达调控

重点：真细菌、古菌和真核生物基因组特点。染色体外遗传因子的种类及功能。为什么微生物被尊称为遗传学研究中的明星。掌握细菌体内基因转移和重组类型。微生物诱变育种、代谢工程育种和基因重组育种的基本原理方法和技术。分解代谢产物阻遏调控。细菌的群体感应调节、生命体的暗物质。

第八章：微生物生态

1. 微生物的生态分布

2. 微生物在生态系统中的作用

3. 微生物功能在环境保护中的作用

4. 污染环境下的微生物

5. 微生物分子生态学

6. 微生物降解能力的遗传计划和退化生态系统的生物修复

7. 人体微生物

重点：种群及其相互作用、群落及其结构、微生物生存的微环境、微生物的吸附及生物膜、污染环境下的微生物、极端环境微生物、生物之间的共生。微生物在驱动自然界生物地球化学循环中的重要作用生态系统中的作用。极端环境微生物的挖掘和重要应用价值。微生物在污染物生物监测、生物处理及污染环境生物修复中的重要作用。微生物在生态系统中的作用，极端环境微生物的挖掘和重要应用价值。微生物在污染物生物监测、生物处理及污染环境生物修复中的重要作用。

第九章 微生物的进化、系统发育和分类鉴定

1. 进化历程

2. 生物进化计时器

3. 原核生物的分类

4. 微生物系统学的研究内容与方法

5. 全基因组测序

6. 微生物的快速鉴定与分析技术

7. 伯杰氏细菌系统学手册

重点：进化计时器的选择、系统发育树、生命的三域学说、原核生物的分类单元及其等级、原核生物中种和菌株的概念、分类单元的命名、细菌分类常用的工具和手册。

第十章 微生物多样性

1. 细菌的多样性

2. 古菌的多样性

3. 真核微生物的多样性

4. 微生物资源的开发利用和保护

重点：各类微生物资源生境特征及多样性特征。

第十一章：微生物生物技术

1. 微生物产业的菌种和发酵特征：生产菌种的要求和来源、大规模发酵特征

2. 微生物产业的发酵方式：连续发酵、固态发酵、混合培养物发酵、固定化细胞或酶发酵

3. 微生物产业的主要产品

4. 微生物生物技术的广泛应用：微生物能源、微生物冶金、微生物与石油工业、微生物传感器和DNA芯片、微生物功能材料、海洋和宇航中的微生物生物技术

5. 微生物生物技术的安全风险评价和管理。

重点：微生物生产菌种的要求和来源、发酵过程的主要控制项目和方法、好氧发酵和厌氧发酵、发酵过程的优化和后处理、微生物产业的发酵方式。微生物在环境保护、产沼气、产酒精方面的重要应用。

四、参考教材或主要参考书：

《微生物学》 沈萍 陈卫东 主编 高等教育出版社 2016